"Da hovedkvarteret for Patrioternes Hemmelige Orden bliver angrebet, tvinges Mickey og Sully ud på en mission for at redde landet fra admiral Ironsides’ onde planer. Admiralen og hans blandede besætning af moderne pirater har taget kontrollen med et stort handelsskib og har planer om at anvende en ny type våben, som kan ødelægge al elektronik i hele verden. Mickey og Sully må finde en måde at redde resten af Patrioternes Hemmelige Orden og sætte en stopper for Ironsides’ onde planer. Hvis det lykkes for Ironsides, er det slut med verden, som vi kender den. "