Der er gået to år, siden Stuart flyttede ind hos familien Little. Men selv om Stuart stortrives, længes han stadig efter at få sin helt egen ven. Så da en skadet fugl ved navn Margalo pludselig lander i Stuarts bil og fortæller, at hun er truet af den onde Falken, lader Stuart hende flytte ind hos familien Little. Men da Margalo forsvinder under mystiske omstændigheder, tager Stuart og katten Snowbell ud på en halsbrækkende og hårrejsende rejse for at finde hende og opklare mysteriet.