The Assassin er en filmatisering af den kejserlige Tang-dynasti-roman ’Nie Yinniang’ og handler om den 10-årige prinsesse Yinniang, der bliver bortført af den tidligere prinsesse og nuværende nonne i eksil, Jiaxin (Zhou Yun). Hos Jiaxin oplæres Yinniang i kampsport og forvandles til en dygtig snigmorder med det ene formål at myrde korrupte politikere. Men hendes empati står i vejen for de koldblodige drab. Derfor fejler Yinniang en mission og hun bliver sendt tilbage til sin fødeprovins Weibo for at myrde guvernøren, Tian Jian (Chang Chen). Men han viser sig at være Yinniangs fætter og barndomskæreste, som hun engang var forudbestemt til at skulle giftes med.